Utdanningen består av en skoleperiode på tre år og en praksisperiode på tre år, totalt seks år. I skoleperioden er utdanningen modulbasert, og ukene veksler mellom språkfag, etterretningsfag, militære ferdighetsfag og ledelse. Når du uteksamineres har du følgelig et bredt tjenestemessig nedslagsfelt, enten det er innenfor områdene etterretning, språk, ledelse eller en kombinasjon av disse.
Hvilke språk studentene får mulighet til å fordype seg i varierer etter Forsvarets behov. Russisk og arabisk er definert som faste språk ved skolen.
I 2013 tar FSES opp studenter innen språkenerussisk og arabisk.
Utdanningen starter på Forsvarets opptak og seleksjon (FOS), hvor man går gjennom blant annet fysiske og psykologiske tester, intervjuer og en ukeslang ledelsesøvelse i felt. De som blir tatt opp som studenter møter kort tid etter opptaket på Sessvollmoen, hvor den militære grunnutdanningen gjennomføres. Etter dette flytter studentene til Lutvann leir og begynner den intensive språkutdanningen.
Videre utover utdanningen er det avbrekk i språkundervisningen med forskjellige etterretningskurs, feltøvelser, kulturfag og trening på militære ferdigheter. Etter dette blir elevene beskikket som befal, og har plikttjeneste som fullt lønnet tilsatt. Etter endt plikttjeneste kan man velge om man vil fortsette i Forsvaret eller gå over til det sivile arbeidsmarkedet eller sivile studier.